据台湾《工商时报》报道，台湾陆委会在2月8日的记者会宣布，自2月10日起，暂停两岸海运客运直航航线及航班，视疫情状况再评估复航，相关机关将尽速完成暂停两岸海运客运直航之相关准备。
台湾陆委会称，考虑疫情已迈入高峰期，并于2月4日决议“入境前14天曾停靠大陆及港澳地区港口的邮轮，不得停靠台湾港口”，同时并宣布自2月6日起“国际邮轮禁止靠泊台湾港口”、自2月10日起“暂停‘小三通’客运船舶往来”，经综合考虑防疫需要，进一步决定自2月10日起暂停两岸海运客运直航，并将由台湾当局“交通部”依规定处理后续事宜。
台湾陆委会称，目前航行两岸海运直航的船舶包括：丽娜轮、海峡号及中远之星。依据统计，2019年两岸直航客运量总计约25万人（含直航包船人数），占岛内两岸海运客运量228万人的11%，其余近9成两岸海运客运量均经“小三通”运送。
有趣的是，在台当局暂停“小三通”的消息传出后，岛内网友留言酸讽：“全都停了，看来陆委会没有业务了，裁了吧！”“小三通，大三通，ECFA…通通都中止，不！通通都终止。台湾，就关起门来做皇帝，法菜吃吃，红酒喝喝，A8飙飙，军公砍砍，锁岛封官小日子，鸡肠鸟肚小雀幸。”“请空心菜废除陆委会…完全没功能，只是养肥猫肥缺的单位”。
